黑山科技研究所，简称黑山基地，亦是黑山集团的科研总部，他们在新墨西哥洲的沙漠中，拥有庞大的驻地，及安保军事力量。
这里是一个极度复杂，安检力量完善的设施，它就像一座小型的城市，完全的自给自足，水力，风力核能发电设施，污水处理中心，他们甚至修建了导弹发射井，用来更好的完成自己的测试。
这里是集物理学大成的巅峰科研基地，无数天才云集于此。反物质测试，高能粒子实验，甚至连跨次元传送门也已经建造完毕并经过了多次测试。
他们深挖地下，并改造为各类秘密危险的实验场所，他们最开始还有所收敛，政府下达的订单和光圈科技共同竞争束缚住他们的手脚。
当他们打败光圈科技后，他们就彻底放飞了自我，失去掣肘的黑山基地彻底放飞自我。
而这是灾难的开始，当神秘人出现并交给他们一块儿特殊的异次元水晶开始，首席科学家伊莱.凡斯的心中就充斥着不安。
虽然他的好朋友克莱纳博士安慰他，一切实验都是正规流程，安全系数达标，不会出现任何意外，但仍然没法让他安下心来。
此前他们肆意妄为的穿梭传送门的行为，就已经危险重重了，他不明白为什么要把步子扯得这样大。
以现有的素材进行研究，完全是足够的。
但说什么都晚了，当二人的实验助手，戈登.佛里曼博士，在上班迟到十五分钟后，急匆匆穿戴好危险环境防护衣准备进行异次元水晶实验的那一刻，就什么都结束了。
串联共振撕开的纬度裂缝，让Xen世界的生物大举入侵地球，从踏入的那一刻就开始撕裂整个地球的生物链，破坏着地球的生态系统。
而隐藏在Xen上的智慧种群，也等候多时。
他们是一种等级制度极其森严的外星生物，尼赫伦斯正是他们仅剩的统治阶级，而作为奴隶阶级的弗地冈人，也只是工人与奴隶。它带领着改造过的异形士兵和控制者入侵了地球，为了躲避追杀着他们的恐怖存在。
它们掌握着心灵感应和传送技术，原本正常的生活在母星的他们，遭到了联合帝国的入侵。
联合帝国可不只是简简单单的普通侵略者，他们是能够跨次元的真正庞大帝国。
尼赫伦斯作为最后一名统治阶级，迫不得已，打开了传送门逃到了Xen和纬度之间的夹缝里苟且偷生，他们在那之后注意到了前来Xen考察的人类，并打算鸠占鹊巢，彻底摆脱联合帝国的追杀。
政府也派出了军队，追杀入侵而来的异形种族，与四处逃难的黑山基地幸存者，他们不能放任知情人士活着离开，更不可能让外星生物大举入侵。
当双方势力纠缠在一起，互相厮杀之时，部分黑山基地的幸存科学家打算试一试关闭Xen的维度裂隙，但失败了，当他们绝望之际，他们看到了一个希望之光。
一个举着撬棍，一路敲爆了路过所有的外星异形的头，捡起地上的枪射穿了一众围追堵截的政府军。
穿着危险环境防护衣，沉默不语的戈登.弗里曼，犹如天神下凡，只身对抗所有的敌人，他英勇的身姿鼓舞了剩余的安保力量和科学家，他们决定，直接撕开Xen世界与本宇宙的薄膜，送博士过去，直接给对面的领导者敲死。
当只身闯入Xen世界的弗里曼穿过危险的食肉丛林，杀穿了Xen世界上无数的原生物种后，他终于来到了尼赫伦斯的工厂，并见到了自己之前杀戮过的无数弗地冈人，但这一次他们没有再攻击，只是像见到瘟神一样躲着他。
没有控制者发号施令，这些掌握着类似于灵能的精神能量的三手外星异形，也只是一群被奴役的可怜虫，不再打算进攻博士，但他们都在角落里默默观察着只身冲进尼赫伦斯所在地的他，那一刻，弗地冈人感觉他们见到了神。
尼赫伦斯很意外自己眼前的小人，它尝试动用自己的精神能量，但都被一直隐藏在幕后的神秘人阻挡，它尝试着用精神力操纵物体砸向他，但也全部被他灵活躲过，它又尝试着对话，但博士根本没有回复过，它绝望至极，没想到自己的命运沦落至此，最后死在了弗里曼博士的手上。
它尝试过警告博士，神秘人，那个只是长得像个人类的未知生物，Gman，把他们从联合帝国的手上救了下来，现在又抛弃了尼赫伦斯的未知生命体。
Gman，找到了更好用的临时雇员，比起他们更管用，更能完成他和他雇主们的计划的新工具，所以尼赫伦斯这个没用的废物，被抛弃是必然的结果。
这个新工具就是人类，也同样是他新招收的两名战力超群的两名临时雇员，不管他们愿不愿意。他用自己的能力，停滞了他们的时间，就再一次的消失不见。
联合帝国找到了尼赫伦斯，找到了Xen世界，找到了地球。
在世界各国政府都忙着清理来自Xen的物种入侵的时候，联合帝国就降临于此，这是一个能跨越宇宙完成扩张的超级帝国，掌握着极其强大的生物改造技术。
它们为地球量身定制了一整套用于侵略的生物兵器，就像它们曾经侵略过无数的其它世界一般，每经过一个世界，经过一个星球，它们就会吸纳当地的优势物种，并为每一个能为帝国服务的生物，资源明码标价。
它们认为，最好的侵略，就是将当地最为强势的生物，整合到联合帝国的一部分中。
狰狞的生物，披着合成的生物装甲，长着让人不寒而栗的粗大黑色绒毛，就这么降临到地球的每一个角落，像螃蟹一样的怪异生物坦克，射出的鞭毛带着腐蚀性液体，直接击穿了人类引以为豪的坦克。
传送门开启在天空，巨大的黑色金属柱状物直接砸在地球的表面，随着他的降落来的是一排排仿佛活着的围墙，联合帝国用了未知的活体金属锻造的围墙，一步步的扩张着，吞噬着人类建造的建筑。
七个小时，人类所有的政府不约而同的宣布投降。
这也就是人们到最后都在念叨的事件，人类这个物种，还能作为一个单独的物种所经历的最后的战争，由前黑山基地的科研主管，布林博士，带头宣布向人类帝国效忠，他也就成为了联合帝国在地球控制力量的代表者，地球伪政权的代理人。
人类被规划在金属塔周围设立的定居点生活，领取着有限的食物和水源。他们在水里加入了未知的药剂，喝下去的人会慢慢变傻，记不住东西。
海洋被直接抽取干净，地球上百分之七十的水资源被全部抽走，游轮和船只直接抛锚在干涸的海床上，剩下的那点，联合帝国也不打算去一点一点收集，他们贯彻着高效的理念，不会浪费多余的资源在这么一点利益上。
大部分金属资源他们也看不上眼，他们只拿走了稀有金属。
联合帝国开启了生物抑制场，来抑制人类这个生物的生殖欲望，毕竟一个低效的物种，已经没有必要繁衍下去了，任何人类的生殖欲望都降低了，抑制场还会破坏母体体内人类胚胎的蛋白质合成，所有幸存下来的人类都成了最后一批。
它们当然不在乎地球上的一切，他们已经拿到自己想要的了。
那些为了更舒适的住所，更丰盛的食物，安全的饮水，和有限的交配权益的人，都加入了联合帝国在地球设立的部队，装甲核心中的国民警卫队，欺负起了身边手无寸铁的同胞，当起了人奸。
还有人会被联合帝国吸纳，和克隆人一起成为在地球的改造人部队，与其他人奸一起管理剩余的人类。
联合帝国很快就找到了人类这一物种在帝国的位置，大部分人被抓走，切除一切内脏，仅仅留下微弱的部分用于维护，切除毛发，手脚，大脑，被做成了类似机仆的蜂巢中最低级的维护工蜂。
联合帝国甚至没有在地球投入任何的科技成果，仅有的付出，仅仅只是那些合金城堡，用地球生物合成的生物兵器，就连管理地球人的都是地球人自己，武器也仅仅只用到了微弱的激光科技，大部分的武器装备也都只是地球人的武器加以改造后再应用的。
铁路，装甲车，都是地球人自己的，联合帝国用最小的资源，来管理地球人，不是没有人反抗，抵抗组织层出不穷，但和它们有什么关系？
被国民警卫队欺压而死的人？被改造人部队射杀的平民？被抵抗组织射杀的装甲核心部队？
反正，最后死的只有地球人，不是吗？