小翔最终没有去救小智，也没有依赖胡帕的力量，而是叫出沙漠蜻蜓，和小遥他们一起慢慢赶往小智和皮卡丘被抓去的岛屿。
小翔也有自己的想法。
和以前的小打小闹不同，超古代神奇宝贝这件事情之后，生之世界的小智，就要开始独自面对传说神奇宝贝的剧情了。
神奥地区的雷吉奇卡斯剧情，合众地区的雷希拉姆剧情，卡洛斯地区的基格尔德剧情。小智将来会被卷入这些传说神奇宝贝和人类的斗争中。如果没有相应的觉悟和能力的话，最后不知道会发生什么事情。
如果说本源世界的小智经历众多剧场版剧情，已经即将毕业，可以独立应付那些突发事件和严重危机了的话。生之世界小智的考验，只是刚刚开始而已。所以，这一次，小翔并不打算直接帮助小智。他要看看，小智出门旅行一年多以后，到底成长到什么样的地步了。
当小翔他们赶到岛屿的时候，整片海域，已经被乌云所包裹。很明显，水舰队刚刚得到的盖欧卡被什么人给惊醒了。这是盖欧卡降雨（神奇宝贝出场时开始下雨）特性即将发动的征兆。恐怕用不了多久，这座岛屿，就会被狂风暴雨所笼罩。
这也是小翔要将小遥他们送走的原因。盖欧卡和固拉多两只神奇宝贝，不是普通的传说神奇宝贝。从古到今，也许有许多神奇宝贝曾经短暂压制过两只太古神奇宝贝。但没有任何一只，可以真正战胜它们。
只要在海中，盖欧卡的力量就无穷无尽。只要能连接大地的地方，固拉多的火焰就永远不会熄灭。
即便是裂空座那种神奇宝贝世界最强的存在，也只能阻止它们的纷争，不能彻底消灭它们。和洛奇亚差不多，它们也是决定这个世界存亡一个关键。
这个关键，小翔是不会让它落到任何人，包括小翔自己的手里的。这两只神奇宝贝，要永远都是自由的才行。
小翔接下来会耐心等待。如果接下来的剧情中，两只超古代神奇宝贝真的会恢复自由，然后两颗宝珠依照剧情被两只神奇宝贝所毁掉的话，小翔就不插手这件事情。但如果不是这样的话，不管火岩队、水舰队是否愿意，小翔都会强行毁掉两颗宝珠。
小翔自信，如果他王牌尽出的话，就算是面对两只太古神奇宝贝，他这边也可以游刃有余。
小翔和小遥他们找到小智的时候，渡也赶到了那里。不过，融合了蓝色宝珠的皮卡丘，却不知去向。
与此同时，和火岩队在岛上谈判的水舰队的水梧桐，在使用红色宝珠的时候，被其力量所控制，失去了意识，导致盖欧卡的暴走。
暴雨狂风突然降临。小遥他们来到海边的时候，可以看到，远处包裹着岛屿的一轮轮漩涡。除此之外，一道道盘绕不散的龙卷风，也让人胆战心惊。不过，最让小遥他们害怕的，应该是那数慢慢向着这边靠近的海啸了。如果被那样的海啸正面冲过来，恐怕岛屿的一切，都会被淹没在其中。
“知道之前我为什么要让你们离开了吧。”小翔对吓呆了的小遥说道。
“小翔，你还说这些。你不害怕吗？”小遥看小翔一副风轻云淡的样子，忍不住着急。
小翔却仍然没有什么反应，自顾自道：“这才只是开始而已。差不多是时候了。马上，固拉多应该也会苏醒。那时候，才是正戏开场的时候。”
“醒夜先生，你打算怎么做！如果是你的话，应该可以阻止两只太古神奇宝贝……”渡心里也很着急。但是，他清楚小翔的力量。知道虽然两只超古代神奇宝贝厉害，却威胁不到神奇宝贝世界最强的训练家小翔。
“不用着急，先看着吧。小智也不要太担心了。皮卡丘应该不会有什么事情。”小翔看到还在不断寻找皮卡丘踪迹的小智，安慰他道。
小翔的话刚说完，水舰队一艘船只的集装箱上，就出现了皮卡丘的身影。皮卡丘站在集装箱上，身上被奇怪的红色花纹所包裹着。小翔注意到，那些花纹和固拉多身上的花纹有点相似。
“原来如此。古代的炼金师们，是通过属性力流动的纹路共鸣来控制超古代神奇宝贝的。这样简陋的方法……不，方法虽然简陋，但效果却很明显。当然，也不是普通人类能够承受得住的……”小翔一个人自言自语，大家都听不懂他在说什么。只有渡勉强可以理解一点。
小智看到皮卡丘的身影，虽然很想过去。但是船只和他们之间隔着海，小智除了大声呼喊“皮卡丘！”之外，其它什么都做不到。
而这个时候，盖欧卡出现了。似乎意识到皮卡丘是让固拉多苏醒的关键。盖欧卡出现后，直接冲向皮卡丘所在的船只。皮卡丘虽然使用了十万伏特，但对盖欧卡这种存在，十万伏特只是挠痒痒一样的效果。
“小翔！”小智看到这样的场景，赶紧向小翔求助。
“嗯。超级电龙，使用雷霆暴雨！”皮卡丘是不能出事的。小翔并不准备直接干涉这件事情。但是，如果小智和皮卡丘遇到危险，他就不能不管了。好在，现在的气候条件，正好满足了雷霆暴雨的使用条件。小翔可以让超级电龙直接发动最强威力的大招。
超级电龙出场后，仰头高鸣一声，全身的电球，更是如一颗颗太阳那样般闪耀起来。然后，从超级电龙身上飞舞出一条蓝色的电龙，直上云霄。
还没有到一瞬间的功夫。大家还没有从超级电龙发出的强光中反应过来，更加刺目的光彩便淹没了这片海域。大家都是紧闭双眼，捂住耳朵。脑袋里，更是除了雷暴的轰鸣之外，容不下其它任何东西。
等强光和轰鸣消散之后，大家发现，雾气中弥漫中，盖欧卡已经倒在海滩附近。虽然看起来没有受到多大的伤，它却一动不能动，眼中的神情，也异常痛苦。
大家可以看到，一道道电花，包裹在盖欧卡的身上。只要它想要动弹，那些电花就开始剧烈闪耀。盖欧卡陷入了麻痹状态。
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